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Perspectivas tecnológicas para la secuenciación del genoma en casa y protección de datos

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Desde el final del Proyecto Genoma Humano hemos sido testigos del constante avance de la tecnología de secuenciación del genoma y de la disminución del precio requerido para llevarla a cabo. Esto condujo a la aparición de servicios comerciales secuenciación del genoma personal con la aparición de algunas empresas hace una década, y la creación de un mercado que se extendió a algunas empresas y laboratorios más hoy en día. Por menos de 1000 euros o incluso menos de 500 euros, es posible hoy en día que un individuo contrate un servicio de secuenciación del genoma completo directo al consumidor y reciba esta información.

Sin embargo, para el ciudadano informado, receloso de la situación actual de la sociedad en lo que respecta a la tecnología y la privacidad, algunas preocupaciones vienen a la mente sobre las garantías de protección del patrimonio genético de un sujeto al considerar la inversión en uno de estos servicios.

Al extrapolar la tendencia pasada del coste por genoma secuenciado , un pensamiento viene naturalmente a la mente:

¿Es razonable esperar que el coste de secuenciar el genoma de un individuo baje tanto en un futuro próximo que permita desarrollar y vender en los próximos años un nuevo tipo de producto con el que se pueda realizar la secuenciación del genoma personal en casa?

Además, permítanme también preguntar:

¿Qué opciones alternativas y mecanismos de seguridad podemos implementar (o prever que se implementen) a nivel personal y colectivo para eliminar esta preocupación de violación de la privacidad y proteger los datos del genoma en los servidores públicos y privados?

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Respuestas (2)

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2019-12-01 13:29:38 +0000

Trabajo en la industria de la seguridad de la información y sigo de cerca la tecnología médica. Su primera pregunta es como si fuera a predecir el futuro, lo cual nadie puede. Sin embargo, le daré mi opinión personal al respecto.

¿Es razonable esperar que el coste de secuenciar el genoma de un individuo baje tanto en un futuro próximo como para permitir el desarrollo y la venta de un nuevo tipo de producto en los próximos años con el que se pueda realizar la secuenciación del genoma personal en casa?

Estimo que la tecnología y la investigación del genoma siguen creciendo de forma constante y que todavía no se han encontrado más usos prácticos y aplicaciones (médicas). Junto con eso, la productividad actual (ver este gráfico ), la eficacia y la precisión siempre pueden ser mejoradas.

Dicho esto, aparentemente hay una gran necesidad de esta tecnología y como hay una necesidad, hay una necesidad inherente de innovación de esa tecnología. La innovación a menudo significa aumentar la productividad (hacer más con menos). La Ley de Moore (aunque actualmente controvertida) es la observación de que el número de transistores en un circuito integrado denso se duplica aproximadamente cada dos años. Dicho esto, se aplica directamente a toda la tecnología que necesita transistores (que es en su mayoría toda la tecnología). Si quieres otro gran ejemplo de tecnología en la que la eficacia ha aumentado y el costo ha bajado drásticamente, mira el desarrollo de la tecnología solar en los últimos 60 años (ver este artículo ). En resumen, sí es muy probable que el costo siga bajando en los próximos decenios._

¿Qué opciones alternativas y mecanismos de seguridad podemos implementar (o prever que se implementen) a nivel personal y colectivo para eliminar esta preocupación por la violación de la privacidad y proteger los datos del genoma en los servidores públicos y privados?

Responder desde una perspectiva de seguridad de la información esta pregunta también sólo puede ser respondida de una manera muy subjetiva, lo que significa que es sólo una opinión. Los datos son datos y los humanos son humanos. Suena tonto pero lo explicaré. Lo ideal sería que todos los dispositivos de secuenciación implementaran una encriptación sólida, a prueba de futuro y quantum-safe en los datos procesados, almacenados y exportados por la máquina. Sin embargo, hay dos problemas aquí.

Primero, los datos son datos. Tecnología barata significa un consenso, cuando los fabricantes de tecnología quieren competir podrían tratar de usar una encriptación más débil o ninguna en absoluto. Además, ¿cómo se hará cumplir esto? ¿Por ley? Entonces, ¿quién hará cumplir esa ley? ¿Qué pasa si la gente hace el dispositivo por sí misma? ¿Qué pasa si los datos son inicialmente encriptados pero más tarde en el proceso son manejados o almacenados de forma insegura?

En segundo lugar, los humanos son humanos. Como en toda la protección de datos y seguridad de la información, el humano es el eslabón más débil de la cadena. Los datos pueden ser manejados correctamente al principio, pero ¿puede esperar de un usuario promedio que se ocupe de procesos técnicos complicados y seguirá siendo tan seguro cuando esos procesos se hagan extremadamente simples y fáciles de usar? Por ley, al menos en la Unión Europea con el Reglamento General de Protección de Datos (GDPR) , las empresas son responsables de proteger sus datos. Pero, una vez que te los entregan de forma segura y los destruyen ellos mismos, se convierte en tu propia responsabilidad.


Además, ¿qué pasa si (algunas) personas quieren compartir esta información por razones médicas. Imagina la enorme cantidad de datos, donde se puede encontrar un gran número de correlaciones entre enfermedades o donde se pueden encontrar nuevas enfermedades no identificadas y causas de enfermedades actualmente desconocidas. Imagine la información que obtendrá del ADN de personas con inmunidad genética a ciertas enfermedades.

_Voy a exagerar un poco ahora, mi disculpa por ignorar completamente el aspecto de la privacidad aquí pero: ¿Sería ético mantener todos estos datos en privado? ¿O es lo único ético hacer que todo sea parte de una investigación médica a escala mundial? Imaginen los casos de uso práctico de todos estos datos. ¿Debería ser un riesgo aceptable? ¿Cuál es el riesgo real de “filtrar” sus datos de ADN de todos modos? ¿Usar los resultados de la investigación global para diseñar el ADN con CRISPR ? Usted deja su ADN físico en cualquier lugar que vaya (ver este artículo ). ¿Limpiamos todos nuestros pelos, células de la piel, otros fluidos corporales que dejamos en todos los lugares públicos para evitar que la gente lo encuentre físicamente? No! Entonces, ¿por qué lo haríamos de otra manera digitalmente en la era de la información?

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2019-12-18 17:44:12 +0000

La primera pregunta se refiere al precio mínimo de venta del hardware de secuenciación del genoma. Como con cualquier producto comercial, el precio depende de la demanda. No preveo mucha demanda para la secuenciación del genoma en casa, por tres razones.

  1. La parte más difícil de las investigaciones genómicas no es obtener los datos, sino interpretarlos. La demanda de interpretación crecerá, y sospecho que ahí es donde estará la competencia. Los productos de interpretación requerirán sus datos para poder funcionar, y siempre será más fácil enviarles un hisopo de la mejilla que poner una complicada pieza de maquinaria en su casa para obtener los datos.

  2. Si las decisiones médicas deben ser tomadas en base a los resultados genómicos caseros, entonces tendrían que dar resultados de muy alta calidad. Probablemente se puede construir un motor a reacción en casa, pero no se volaría en un avión propulsado por su motor. Así que no veo que la demanda de pruebas médicas genómicas caseras coincida con la demanda de pruebas de presión sanguínea caseras, sobre las que se están tomando decisiones hoy en día, pero siempre con un doble control obtenido en la clínica.

  3. Si el uso previsto no es médico, puede haber un solapamiento del mercado con los sistemas portátiles de investigación (por ejemplo, Nanopore). Los puntos de precio en ese mercado serán más altos que para los usos domésticos de los consumidores, si no es por otra razón que los investigadores obtendrán más valor de las pruebas portátiles que los consumidores. Usted podría usar la máquina una vez en usted y en su familia, amigos y mascotas, y nunca más.

La segunda pregunta se refiere a la protección de la información genómica una vez que ha salido de los confines del hogar. Es imposible hacerlo con certeza. Si se desarrolla un mercado atractivo para la información genómica, entonces incluso las personas y empresas de confianza violarán esa confianza, a pesar de las sanciones legales que puedan surgir, y a pesar de los controles tecnológicos existentes. La información es información, y si existe en algún lugar en forma legible durante cualquier período de tiempo, puede ser copiada. La única pregunta es cuántas personas necesitan ser sobornadas o corrompidas de alguna manera. Los administradores de sistemas no son incorruptibles.

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