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¿Por qué el modelado de medicina se distribuye en las computadoras de las personas normales?

Hay algunos proyectos de computación distribuida en Internet que tratan de encontrar la cura para las enfermedades, como World Community Grid . ¿Podría alguien decir por qué hay tales cosas y cuán útiles son? Quiero decir, creo que si eres un investigador serio, creo que eres capaz de usar las redes o supercomputadoras de la universidad para hacer modelos. Entonces, ¿cuál es la idea de extender el modelado a los ordenadores normales? ¿Requiere la modelización de la medicina tanta potencia informática que los ordenadores de las universidades no tienen suficiente potencia de cálculo?

Respuestas (1)

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2018-11-07 11:22:05 +0000

No sé cuán fácil es conseguir supercomputadoras para los investigadores y las universidades, pero me imagino que gran parte de la respuesta a su pregunta se debe al costo.

Supercomputadoras vs Proyectos de Computación Distribuida

El rendimiento de las computadoras se mide en FLOPS (Floating Point Operations Per Second) , y en junio de 2018,&nbsp Summit , una supercomputadora construida por IBM que ahora funciona en el Oak Ridge National Laboratory (ORNL) del Departamento de Energía (DOE), capturó el punto número uno para el rendimiento más rápido de la computadora en  122. 3 petaFLOPS en el LINPACK benchmark donde peta es 1015. Cuando se compara con los PCs domésticos, el procesador de PC doméstico más rápido posible a un costo de 2.000 dólares proporciona aprox. 1 teraFLOPS donde tera es 1012.

Para proyectos de computación distribuida, veamos Folding@home .

El proyecto utiliza los recursos de procesamiento ociosos de miles de computadoras personales propiedad de voluntarios que han instalado el software en sus sistemas. Su principal objetivo es determinar los mecanismos de plegamiento de las proteínas, que es el proceso por el cual las proteínas alcanzan su estructura tridimensional final, y examinar las causas del plegamiento de las proteínas. Esto es de gran interés académico con importantes implicaciones para  la investigación médica  en  la enfermedad de Alzheimer,  la enfermedad de Huntington, y muchas formas de  cáncer, entre otras enfermedades. En menor medida, Folding@home también intenta predecir la estructura final de una proteína y determinar cómo otras moléculas pueden interactuar con ella, lo que tiene aplicaciones en el diseño de fármacos. Folding@home es desarrollado y operado por el Laboratorio PANDE en la Universidad de Stanford

[…]

Desde su lanzamiento el 1 de octubre de 2000, el Laboratorio PANDE ha producido 200 documentos de investigación científica como resultado directo de Folding@home véase [https://foldingathome. org/papers-results]

Las estadísticas proporcionadas por Folding@home en https://stats.foldingathome.org/os declaran que su proyecto proporciona un rendimiento total de 47.344 teraFLOPS nativos o 98.747 x86 teraFLOPS.

Nótese que estos valores de teraFLOPS provienen de los núcleos de software, no los valores máximos de las especificaciones de la CPU/GPU y estas cifras sólo acaban de superar el rendimiento de la Sunway TaihuLight de China en 2016 que fue clasificada como la más rápida del mundo con 93 petaFLOPS en el benchmark LINPACK ahora la 2ª supercomputadora más rápida ).

Costo

Supercomputadora de la Cumbre de IBM costo de 200 millones de dólares para construir y según Wikipedia, la Sunway TaihuLight costó 273 millones de dólares. Si se considera que el rendimiento de computación proporcionado por Folding@home es proporcionado por voluntarios (por lo que el sistema es gratuito), no hay que pensar que el poder de computación ofrecido no debe ser rechazado.